iPhone/iPad/iPod touch用のアプリケーションで分子を表示する

  • 結晶構造の表示はこちら(iPadで結晶構造表示)もご覧下さい。
  • Moleculesというのがあります.App Storeから無料でダウンロードできます.これは分子用に作られてますが,結晶でどの程度使えるかをテストするための結晶データを作ってみました.pdbフォーマットにしか対応してないので,pdbに変換するためにVestaを使用しました.Vestaで適当に表示されている状態でpdbフォーマットでExportする.wiki上ではうまくリンクが出来ないので,別途リンク用ページを作った.iPhone/iPodのSafariからこのリンク先htmlの中の各データをクリックすると,自動的にMoleculesを起動してデータを読んでくれる.もちろんMacのSafariでリンクをクリックしてもダメ.
  • 残念ながらMoleculesはball-and-stickとcylinder表示くらいしかできないので,多面体表示に慣れている私には多少見づらいが,iPhone/iPod touch上でグルグル回転させて遊ぶと楽しい.下の写真は第1世代touchで石英の高圧相であるstishovite(ルチル構造)を表示しているところ.緑がシリコン,赤が酸素原子.原子は拡大して見ると球ではなく,多面体で近似している.
    molecules-ipod.png
  • 以下は各データのurlであるが,Moleculesからこれらを入力するのは面倒なので,上記のようにここからiOSデバイスのSafari経由でデータを読み込むほうが簡単.molecules://とするのはMoleculesを起動するためのおまじないのようです.
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Ca2IrO4.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Ca2SiO4-beta.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/CaTiO3-perovskite.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Fe2O3.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Mg(OH)2.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/MgSiO3-opx.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Si3N4-alpha.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Si3N4-beta.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/Si3N4-gamma.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/SiO2-coesite.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/SiO2-low-cristobalite.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/SiO2-quartz.pdb
    • molecules://www.misasa.okayama-u.ac.jp/~masami/mol/SiO2-stishovite.pdb

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Last-modified: 2009-01-23 (金) 18:10:43 (3223d)